Année 1999
Janvier
Février
Une instruction de l’EMM modifie l’organisation des BAN à compter du 1er juillet : création de commandants adjoints, le personnel civil est placé sous la responsabilité du commissaire de la base et création de CEI sur les bases d’hélicoptères à l’instar de ce qui existe sur les bases de la patrouille maritime. La 32 F hélitreuille 18 membres de l’équipage du cargo Picasso en perdition dans le golfe de Gascogne. Le GAN en Adriatique est survolé par l’avion du Président de la République escorté par cinq Crusader.
Mars
Avril
Le deuxième Hawkeye (n° 1) est livré à Lann-Bihoué et affecté à la FAGE.
Le Charles-de-Gaulle poursuit sa campagne d’essais et le Foch dépasse le cap des trois mois de mission (Trident) en Adriatique.
Mai
Le CEMM rend visite au Charles-de-Gaulle ; le Foch quitte l’Adriatique pour aller se refaire une beauté à Toulon (remise à niveau des installations, en particulier pour les deux catapultes) ; son bilan est éloquent : 119 jours à la mer en opération, 476 sorties au combat pour son GAE.
Juin
La frégate Aconit est admise au service actif avec à son bord un Panther de la 36 F.
Des échanges d’instructeurs entre l’armée de l’Air et la Marine marquent le début du transfert des formations à la maintenance aéronautique de la Marine, dispensés au CEAN de Rochefort, vers la BA 721 de Saint-Agnant (échéance en 2002).
Juillet
Août
Les essais aviation du Charles-de-Gaulle se poursuivent : appontages et catapultages de l’Hawkeye, célébration du 200e appontage ; le PA reçoit la visite du Président de la République. Le Foch, en entraînement avec un équipage renouvelé, est maintenu en alerte.
A Cognac, deux Epsilon de l’Ecole de pilotage de l’armée de l’Air de Cognac se percutent en vol ; l’EV1 Fourdan, moniteur à la SME est tué.
Septembre
Le CEI de Saint-Mandrier est créé à son tour, c’est le pendant méridional de celui de Lanvéoc-Poulmic créé en juillet. La 34 F fête son quart de siècle en affichant un bilan de 75 000 heures de vol, 80 000 appontages dont 23 000 de nuit. Le Falcon 50M n° 36 est livré au CEPA. La Marine confirme « les actions engagées pour adapter ses structures sous un grand commandement unifié entraînant une rationalisation de ses moyens aériens » par le biais d’un « rapprochement avec l’armée de l’Air dans les opérations d’entretien et de maintien en conditions opérationnelles des Rafale ». Certains observateurs se posent des questions sur l’avenir de l’Aéronautique navale à long terme…
Le Rafale M1 rejoint le CEV d’Istres pour des essais de qualification du standard F1. La Marine participe à la force multinationale qui se met en place pour rétablir la paix et la sécurité au Timor oriental en envoyant sur place des frégates de surveillance Vendémiaire et Prairial, et le TCD Siroco (opération Santal) ; des hélicoptères de l’Aéronautique navale et de l’ALAT sont embarqués sur ces navires ; l’opération se terminera en fin janvier 2000.
Octobre
L’escadrille 23 S et la flottille 33 F sont dissoutes à Saint-Mandrier ; elles donnent naissance le même jour à une nouvelle flottille d’hélicoptères , la 35 F (photo). Les Super-Frelon sont recentrés sur les missions SECMAR et abandonnent les missions RESCO reprises par l’armée de l’Air dans le cadre d’un futur OVIA.
Le Charles-de-Gaulle débute sa RANAE dans le bassin n° 8 de l’arsenal de Brest ; il va y rester pendant sept mois. Le Foch et son GAE participent à la sortie d’entraînement baptisée PEAN 99 en Méditerranée occidentale ; 
La 6 F fête les 40 ans de l’Alizé sur le Foch et effectue le 74 000e appontage à bord du porte-avions. Le CEMM annonce que l’une des deux bases d’hélicoptères dans le sud de la France sera dissoute mais le choix n’est pas encore fait entre Hyères et Saint-Mandrier ; il fait, d’autre part, examiner la validité opérationnelle du concept de biplace de combat (il s’agit du Rafale Marine biplace).
Novembre
Le GEAOM ( Jeanne-d’Arc et Georges –Leygues) quitte Brest pour sa campagne annuelle ; son GAE est composé d’Alouette III de la 22 S, de Gazelle et Puma de l’ALAT.
L’état-major de la SIMMAD , regroupant du personnel des trois armées et de la DGA, se constitue à la Cité de l’Air à Paris dans le cadre d’un futur OVIA. La Marine expérimente le drone Hunter sur le Jean-Bart. La restriction d’accès aux femmes aux emplois dans les équipages d’avions embarqués est supprimée.
Décembre
La DGA négocie l’éventualité d’une vente du Foch à la Marine brésilienne.
La 12 F est mise en sommeil (photo) suite au retrait définitif des Crusader en service depuis 1964 !
La 32 F et la 34 F participent au sauvetage des 26 marins de l’Erika qui coule au large de Saint-Nazaire.
Un Lynx de la 31 F prend feu après un atterrissage forcé à Collobrières (Var) causant la mort de son commandant de bord le LV Rioult. Pendant les fêtes de fin d’année la Marine met en alerte, dans le cadre du plan Vigipirate, un Super-Frelon, cinq Dauphin et deux ATL2 (hors plan Polmar).
Au cours de l’année la BAN de Toussus-le-Noble prend le statut d’un EAN.
Formations aériennes au 31 décembre 1999
| Flottilles | |||||||||||||
| Avions embarqués | Patrouille maritime | Hélicoptères | |||||||||||
| 6F | Nîmes | ALH | 21F | Nîmes | ATL2 | 31F | St Mandrier | Lynx | |||||
| 11F | Landivisiau | SEM | 23F | Lann-Bihoué | ATL2 | 32F | Lanvéoc | S.Frelon | |||||
| 16F | Landivisiau | Et IVP | DauphinSP | ||||||||||
| 17F | Landivisiau | SEM | 34F | Lanvéoc | Lynx | ||||||||
| 35F | St Mandrier | Dauphin, | |||||||||||
| Al III,SuperF | |||||||||||||
| FAGE | Lann-Bihoué | E-2C | 36F | St Mandrier | Panther | ||||||||
| Escadrilles | ||||||||||||||
| Servitudes | Surveillance | Ecoles | ||||||||||||
| 2S | Lan-Bi. | Xingu, N262 | 9S | Tontouta | Gardian | 50S | Lanvéoc | Rallye,CAP10 | ||||||
| 3S | Hyères | Xingu, N262 | 12S | Faaa | Gardian | 56S | Nîmes | N 262E | ||||||
| ERCE/10S | Hyères | Lynx, Al.III, | 57S | Landivisiau | DA10 | |||||||||
| Rallye, F 50 | Hélicoptères | |||||||||||||
| 22S | Lanvéoc | Al. III | ||||||||||||